Die häufigste Ursache eines Vitamin B12 Mangels beim Neugeborenen ist ein mütterlicher Vitamin B12 Mangel. Dieser kann durch eine zu geringe Zufuhr von Vitamin B12 aus der Nahrung bei zugleich erhöhtem Bedarf während der Schwangerschaft (vor allem in dem letzten Drittel) entstehen. Besonders gefährdet, einen Vitamin B12 Mangel zu haben, sind Frauen, die wenig Fleisch und andere tierische Nahrungsmittel essen (zum Beispiel bei vegetarischer oder ganz besonders bei veganer Ernährung). Es kann aber auch eine Erkrankung der Mutter einen solchen Mangel verursachen, zum Beispiel eine chronische Magenschleimhautentzündung oder Autoimmunerkrankung.